相同点：
MBA和MEM都属于管理类，考试科目是一样的，且可以互相调剂。联考为两门：英语和管理综合。综合又分为语文、数学、逻辑。考生在报名时须满足以下条件：大学本科毕业后有三年或三年以上工作经验的人员;获得国家承认的高职高专毕业学历后，有五年或五年以上工作经验，达到与大学本科毕业生同等学力的人员;已获硕士学位或博士学位并有两年或两年以上工作经验的人员。
不同点：
一、概念不同
MBA是指工商管理硕士(Master of Business Administration)，是培养能够胜任工商企业和经济管理部门高层管理工作需要的务实型、复合型和应用型高层次管理人才。
MEM是指工程管理硕士(Master of Engineering Management)，是2010年新设置的一种专业学位。其目的是适应我国现代工程事业发展对工程管理人才的迫切需求，完善工程管理人才培养体系，创新工程管理人才培养模式，提高我国工程管理的人才质量。培养注重向学生提供对核心管理领域知识的理解能力。
MBA课程的重点多集中在金融、市场学、财务和组织管理等。而MEM工程师可能比较需要有关项目、流程、运作、供应链和原材料等管理的知识。
二、学习侧重点不同
MBA(工商管理硕士)：特别强调在掌握现代管理理论和方法的基础上，通过商业案例分析、实战观摩、分析与决策技能训练等培养学生的实际操作技能，使学生接受知识与技能、个性与心理、目标与愿望等方面的挑战，更具有职业竞争的实力，而其他研究生则侧重于理论学习、学术研究。
MEM(工程管理硕士)：主要注重于技术专长、社会经验、项目管理和设计/开发等，同时适度补充财务和市场方面的知识，以及增长国际交流经验。工程管理硕士为广大工程技术骨干人员未来成长为工程项目管理者，提供了一条较为有利的发展路径。